Манжерок расположился на плато в подножии гор Синюха и Малая Синюха в 2 км от Чуйского тракта на правом берегу Катуни. Вокруг озера образовался неповторимый оазис с мягким микроклиматом. В 1996 г водоем получил статус природного памятника. Чтобы посмотреть на Манжерок с высоты, можно подняться на Малую Синюху на подъемнике.
Водоем заметно отличается от всех горно-алтайских озер многообразием водной растительности. В этом месте растет более 20 видов. Самое экзотическое растение Манжерока — Рогульник или Чилим. Этот водяной орех есть в Красной Книге. Во время цветения он плывет по водной глади и по мере вызревания уходит ко дну. Его прозвали «чертов орех», поскольку форма напоминает голову черного рогатого черта. Съедобные ядра содержат большое количество крахмала. Когда рогульник не был редким растением, его употребляли в пищу, применяли в лечении.
В районе одноименного села уровень воды в озере превышает уровень Катуни на 88 м. Водоем слабопроточный. В летние месяцы верхний слой прогревается до 20-24°C. Озерная вода содержит большое количество микроэлементов, поэтому имеет специфический запах и вкус, обладает целебными свойствами.
В июле озеро покрывается цветущим ковром из белых лилий. На его берегу устраивают гнезда разные птицы, часть из них занесена в Красную Книгу. В Манжероке много карася, линя, окуня, карпа, щуки. В этом месте можно рыбачить круглый год.
На востоке и юго-востоке горные склоны окутаны деревьями и кустарниками. Лесная растительность спускается прямо к воде. Большая часть берега заболочена. Удобный подход к озеру есть лишь на северо-западной стороне, где расположена дорога.
Манжерок пользуется большой популярностью у туристов. В его районе развита инфраструктура, находятся туристические базы. В это место также организуют экскурсионные туры и с других турбаз, располагающихся вдоль всего Чуйского тракта.
Чтобы попасть на озеро, нужно ехать по Чуйскому тракту на юг. А возле одноименного села повернуть налево к поселку Озерное, на дорогу, ведущую в гору. Оттуда есть тропа налево, пролегающая вдоль озера.